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2×CTAB提取液(植物基因组DNA提取)JNC92071

2×CTAB提取液(植物基因组DNA提取)JNC92071

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2×CTAB提取液(植物基因组DNA提取)

中文名:2×CTAB提取液(植物基因组DNA提取)

英文名:2×CTAB Solution

CAS:N/A级别:N/A

分子量:N/A分子式:N/A

纯度:N/A储存条件:RT

产品简介

储存条件:常温保存,保质期2年。

产品内容:

2021111602293971710

产品说明:

  CTAB(hexadecyltrimethylammonium bromide,十六烷基三甲基溴化铵),是一种阳离子去污剂,具有从低离子强度溶液中沉淀核酸与酸性多聚糖的特性。在高离子强度的溶液中(0.7mol/L NaCl),CTAB与蛋白质和多聚糖形成复合物,只是不能沉淀核酸.通过有机溶剂抽提,去除蛋白、多糖、酚类等杂质后加入乙醇沉淀即可使核酸分离出来。

使用方法:

一、试剂准备

1、氯仿-异戊醇混合液(24:1)。96mL氯仿加4mL异戊醇混匀。

2、65℃预热CTAB溶液后将1mL 还原剂加入CTAB溶液中。

二、操作步骤

1、液氮研磨0.1g左右植物组织,转移到1.5mL离心管中,加入700uL 2×CTAB提取液(已加入还原剂)。或者液氮研磨之后,在研钵中加入700uL 2×CTAB提取液,然后吸取到1.5mL的离心管中(建议总体积不要超过1mL)。

2、将离心管置于65℃水浴30min-1h,期间每隔10min左右轻轻晃动离心管。

3、水浴完成后冷却2min,加入0.5mL的氯仿-异戊醇混合液,剧烈震荡混匀。10000-12000rmp离心5-10min。

4、取上步离心管中上清液到新的离心管中。

注意:上步离心后应该会分三层:上层为水相,中间为蛋白和植物碎片,下层为有机相。吸取时避免触及蛋白和有机相。如不小心吸取到中下层,或者中间层较厚,建议少吸取水相,或吸取之后再加入500uL氯仿-异戊醇混合液,重新混匀离心取上清。

5、在上清中加入等体积的异丙醇,颠倒混匀。(或加入2倍体积的无水乙醇和1/10体积的3M pH5.2的乙酸钠) 。置于-20℃沉淀30min以上,12000rmp离心10min,弃上清。


6、 沉淀用75%乙醇洗涤1次,12000 r/min离心3-5 min,弃上清,沉淀自然干燥后溶于50uL去离子水或者TE中,加入1 uL RNase(20 ug/mL),37摄氏度温育30 min。

7、置于-20℃保存。

备选方案:

1、可以加入适量PVP去除多糖多酚污染。PVP(聚乙烯吡咯烷酮)是酚的络合物,能与多酚形成一种不溶的络合物质,有效去除多酚,减少DNA中酚的污染;同时它也能和多糖结合,有效去除多糖。

2、可以在加入CTAB提取液之后震荡混匀,5000rmp离心2min取上清,沉淀为未研磨充分的碎片或者不溶物。然后在上清中加入氯仿-异戊醇混合液纯化,可以有效去除未裂解的植物碎片。

3、可以在加氯仿-异戊醇混合液之前,加入tris酚(pH>7.8)-氯仿混合液震荡离心取上清后,再用氯仿-异戊醇混合液纯化。可以有效去除蛋白污染。

常见问题:

问题一:DNA样品不纯,抑制后续酶解和PCR反应。

     原因:1.DNA中含有蛋白、多糖、多酚类杂质

2.DNA在溶解前,有酒精残留,酒精抑制后续酶解反应

3.DNA中残留有金属离子

     对策:1.重新纯化DNA,去除蛋白、多糖、多酚等杂质(具体方法见前)

2.重新沉淀DNA,让酒精充分挥发

3.增加70%乙醇洗涤的次数(2-3次)

 问题二:DNA降解,DNA提取量少。

     原因:1.实验材料不佳或量少

2.破壁或裂解不充分

3.沉淀不完全

4.洗涤时DNA丢失

      对策: 1.尽量选用新鲜(幼嫩)的材料

2.动植物要匀浆研磨充分;G+菌、酵母裂解前先用生物酶或机械方式破壁

3.高温裂解时,时间适当延长(对于动物细胞、细菌可增加裂解液的用量)

4.低温沉淀,延长沉淀时间

5.加辅助物,促进沉淀

6.洗涤时,最好用枪头将洗涤液吸出,勿倾倒

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